La provincia de Misiones lleva adelante el programa de Nutrición Escolar a través de la Dirección de Comedores Escolares del Ministerio de Cultura, Educación, Ciencia y Tecnología. El mismo se encarga de controlar la nutrición de los estudiantes como así también establecer estrategias para mejorar la alimentación de los mismos.
Se trata de un programa co-financiado con Nación, administración que ha disminuido la cantidad de establecimientos escolares de los que se hace cargo. De esta manera, Misiones abastece a 1265 escuelas mientras que el Gobierno Nacional llega a 135, que desde junio de 2016 no aumenta sus partidas.